偶蹄目動物對口蹄疫病毒均有一定程度的易感性。偶蹄目之外，其它一些動物也可感染口蹄疫，但流行病學意義尚不明確。

    1、家畜

    口蹄疫的家畜宿主包括牛、豬、綿羊、山羊、牦牛、水牛，試驗性感染成功的家畜宿主有羊駝和駝馬。雙峰駝可發(fā)生口蹄疫，單峰駝對口蹄疫病毒不敏感或敏感性很差。家畜中：綿羊是口蹄疫的貯存器——綿羊癥狀溫和，容易因忽視而傳播。豬是口蹄疫的放大器——口蹄疫豬每天的病毒排出量可達4億個感染單位，是牛、綿羊和山羊的3000倍以上，有利于形成空氣傳播。牛是口蹄疫的指示器——牛對口蹄疫病毒非常敏感，口蹄疫癥狀最為明顯。

    2、野生動物

    已知口蹄疫病毒可感染的野生動物宿主種類大于70個，主要是偶蹄動物，包括美洲野牛、水牛、長頸鹿、多鹿科動物（馴鹿、鹿和麋鹿）、多種羚羊、小羚羊、牛羚、印度羚羊、疣豬、捻角羚、黑斑羚、瞪羚。

    3、其它動物

    少數(shù)非偶蹄目動物種也可感染口蹄疫病毒，例如刺猬（包括廣泛分布于歐亞大陸的普通刺猬）、熊、犰狳（中美和南美）、袋鼠、海貍鼠、水豚。亞洲象有幾例病例報道，但極少有非洲象感染的報道，一般認為非洲象在自然條件下不易感。試驗室動物模型包括豚鼠、大鼠和小鼠，但在田間情況下，一般認為這些動物在口蹄疫的傳播中不重要。早期報道表明，牛和普通刺猬之間可發(fā)生口蹄疫傳播，但過去的50年沒有確鑿證據(jù)表明普通刺猬能夠使口蹄疫蔓延。

    4、維持宿主

    維持宿主是指對特定的生態(tài)系統(tǒng)中，對特定的病原體來說，可作為病原體的持續(xù)性傳染源的動物群。

    在大多數(shù)地區(qū)，牛是口蹄疫的重要維持宿主；少量病毒對豬發(fā)生宿主適應，使病毒獲得在豬群中獲得循環(huán)和擴散的能力；還有一些病毒可能在水牛之間循環(huán)，在非洲，非洲水牛是口蹄疫病毒重要的維持宿主，這些病毒的主要血清型是SAT，但在這些水牛體內(nèi)也發(fā)現(xiàn)了其它血清型抗體。牛不存在的情況下，不能確定小型反芻動物是否可以長時間維持口蹄疫病毒，作為循環(huán)和擴散的貯源。其它野生動物似乎不能維持口蹄疫病毒，只能被家畜或水牛散播的病毒感染。

    5、口蹄疫病毒的攜帶者

    病毒攜帶者通常指病原體感染后體內(nèi)攜帶病毒核酸或活病毒超過28天的動物。無論感染后是否出現(xiàn)臨床癥狀，動物均可成為攜帶者。

    大多數(shù)物種，口蹄疫病毒只能在攜帶者的食道-咽部液體內(nèi)找到，其它分泌物和排泄物中找不到，例如口腔和鼻腔拭子；但最近，人們在實驗感染的水牛攜帶者的鼻液內(nèi)分離到了病毒。非復制性的病毒可以在反芻動物感染38天后的淋巴結(jié)內(nèi)找到。口蹄疫攜帶者的流行病學意義，尚未確定，存在爭議。盡管有攜帶者引發(fā)明顯傳染的傳說，且攜帶者的食道-咽部液體直接注射給動物后具有感染性，但在所有對照試驗中，家畜通過密切接觸攜帶者，均未發(fā)生感染；唯一成功的試驗是非洲水牛SAT攜帶者，可以將病毒傳播給其它水牛，偶爾可傳播給牛。研究者推測，這種情況下，可能是性傳播致病，因為精液中可分離到口蹄疫病毒，并且，所有成功的接觸感染試驗都同時用到了公牛和母牛。

    不同的口蹄疫攜帶者攜帶病毒的時間如下：

    大多數(shù)牛攜帶口蹄疫病毒不超過6個月，但受疫苗或先前感染的影響，一些個體攜帶病毒時間長達3.5年。

    病毒或病毒核酸能夠在綿羊體內(nèi)存在長達12個月，不過，大多數(shù)情況下綿羊只能攜帶病毒1～5個月。

    山羊4個月。
    水牛1年。
    牦牛8個月。

    非洲水牛個體的攜帶者狀態(tài)可持續(xù)至少5年，病毒可在一個野牛群中循環(huán)存在至少24年。

    駱駝科動物似乎不是攜帶者。

    一般認為，豬不是攜帶者，到有少數(shù)報道證明病毒核酸可在豬身上存在大于28天。這可能是假象，原因是病毒遺傳物質(zhì)在動物體內(nèi)降解速度慢。

    試驗性的持續(xù)感染可在一些野生動物中產(chǎn)生，包括黇鹿、梅花鹿、捻角羚、馬鹿。一些鹿可攜帶口蹄疫病毒長達2.5年。

    早期研究中，褐鼠試驗性感染可攜帶病毒超過4個月。